东南亚地区占领后，接下来需要重新审视的就是乌斯藏和亦力把里这两处地方。
名义上，乌斯藏已经属于大明的领地，虽说实际控制权不再大明朝廷手里，但这一带都是海拔两千以上的高原，工业利用价值不大，即便有矿产资源也没法开采和运输。
因而也就没多大必要去实行改土归流，发展工业。
不过，这并不说明，这块地方毫无用处，在战略位置上却是一块极为重要的地方，乃整个亚洲腹部的高地，南可俯视南亚，北可控亦力把里，大明即便不在这鸟不拉屎的地方发展工业，也得在这里驻军，以备他日南下或者北上。
与唐时不同，这个时代的乌斯藏不是当年的吐蕃，在佛法的普度下，没有了当年的扩张之心，只一味好佛念经，上层贵族更是被僧人占据，自乌斯藏归附大明以来，大明朝廷也不知道封了多少法王活佛。朱由也没打算要在这里实行改土归流，毕竟这一带除了青稞以外也不适合农业生产与工业生产。
当然，出于军事角度考虑，既然驻军肯定是要出兵的。
好在，在十多年前即天启十六年的时候，蒙古和硕特部一部由伊犁进入乌斯藏，占据大明原设在西宁四卫，并在之后的日子里趁着大明忙于国内禁烟国外发动殖民战争之机，悍然占领了乌斯藏地区，如此一来，就给了大明进兵乌斯藏的口实。
因而按照朱由校的指示，在礼部派遣专员告知乌斯藏番王大明将会派遣军队涤除鞑子并将长期驻军保护当地安全与帮助当地居民建设的同时，兵部则派遣了第四军第二镇由云南丽江府进乌斯藏，且兵分两路，一路往拉萨，一路往西宁四卫而去。
无论是蒙古和所特部骑兵还是依附和所特部的乌斯藏土兵，自然不是大明陆军的对手，真正考验大明陆军的还是在这种极地环境下的行军与驻扎生活，以及交通的建设和其他公共设施的建设。在将来，还有许多气候恶劣的地方需要大明驻军，比如北冰洋上的岛屿，这些地方资源丰富，趁着这一带归属地还不明确的时候自然是先占住为强。
大明的蒸汽战车虽然动力也不差，但到底还是比不上五菱宏光，底牌虽然比法拉利高，可没有很好的恒温设备，液体水与蒸汽气体没法抵抗严寒，因而战车是不能进入乌斯藏的，大炮也因为没有318国道也不能运，只能带着枪械与小型大明版迫击炮进入乌斯藏，不过即便如此，在艰难跋涉进藏区后依旧轻而易举地击败了和硕特部，且直接驻军成功。
为保证乌斯藏安全，大明决定直接统治该地区，实行地方自治但由中央任免的行政方式，但文化与经济建设则由大明军队主导，理由是帮助乌斯藏的百姓脱贫致富，让他们更有精力去研究佛理，当然这也是变相的进行文化输入。